Lisina (Lys, K)
La lisina es un aminoácido básico con una cadena lateral larga que termina en una amina primaria. Tiene carga positiva y es el punto de unión más común para lípidos, marcadores y conectores en los péptidos.
Estructura y propiedades
La lisina tiene una cadena lateral flexible de cuatro grupos metileno que termina en un grupo épsilon-amino, protonado y con carga positiva a pH fisiológico. La cadena larga permite a la lisina extenderse para formar puentes salinos e interactuar con fosfatos y carboxilatos, mientras que sus grupos metileno le añaden cierto carácter hidrofóbico. La lisina está muy expuesta al solvente en las proteínas plegadas. La épsilon-amina es un buen nucleófilo una vez desprotonada, por lo que reacciona con ésteres activados, aldehídos y otros electrófilos. En las células, las cadenas laterales de lisina presentan muchas modificaciones postraduccionales, como acetilación, metilación y ubiquitinación. La tripsina corta después de la lisina y la arginina.
Función en los péptidos
La lisina es el sitio habitual de modificación de cadenas laterales. En la semaglutida y la tirzepatida, una cadena lateral de lisina porta el diácido graso que impulsa la unión a la albúmina. En PT-141 y Melanotan II, la lisina forma un puente lactama con el aspartato para cerrar el anillo. La lisina es el residuo C-terminal de GHK-Cu y el primer residuo de KPV, y aparece en SS-31, la ipamorelina y GHRP-6. Las secuencias ricas en lisina contribuyen al carácter catiónico de LL-37. La lisina también es un sitio frecuente para unir marcadores fluorescentes o biotina en reactivos de investigación.
Estabilidad y análisis
La lisina es estable en almacenamiento, pero su amina es reactiva. Puede formar aductos con azúcares reductores, aldehídos o formaldehído procedentes de excipientes o solventes, y puede ser acilada por impurezas reactivas. En la síntesis, la eliminación incompleta del grupo Boc de la cadena lateral o la acilación no deseada de una lisina mal protegida produce especies ramificadas o aductos detectables por espectrometría de masas. Cada lisina se une a un contraión, por lo que los péptidos ricos en lisina contienen más trifluoroacetato o acetato por unidad de peso.
En los compuestos de PeptideWiki
Compuestos cuya secuencia contiene lisina, con el número de apariciones.
- Timosina β4 (9)
- LL-37 (6)
- Abaloparatida (4)
- Timosina α1 (4)
- IGF-1 LR3 (3)
- Teriparatida (3)
- VIP (péptido intestinal vasoactivo) (3)
- CJC-1295 (2)
- Calcitonina (de salmón) (2)
- Exenatida (2)
- Matrixyl (palmitoyl pentapeptide-4) (2)
- Sermorelina (2)
- TB-500 (2)
- Tesamorelina (2)
- Afamelanotida (1)
- BPC-157 (1)
- GHK-Cu (1)
- GHRP-2 (1)
- GHRP-6 (1)
- Humanina (1)
- Ipamorelin (1)
- KPV (1)
- MOTS-c (1)
- Melanotan II (1)
- PT-141 (bremelanotida) (1)
- Pramlintida (1)
- SS-31 (elamipretida) (1)
- Selank (1)
Preguntas frecuentes
¿Por qué se usa la lisina para la lipidación?
La épsilon-amina se encuentra al final de una cadena lateral larga y flexible, por lo que modificarla suele dejar intactos el esqueleto y los residuos de unión al receptor. Los grupos protectores ortogonales permiten a los químicos desenmascarar una sola lisina en la resina y unir selectivamente un ácido graso, un espaciador o un marcador. La semaglutida y la tirzepatida usan este enfoque para unir un diácido graso a través de un conector, lo que da una unión reversible a la albúmina.
¿Qué es un puente lactama?
Un puente lactama es un enlace amida formado entre una amina de cadena lateral, normalmente de lisina, y un carboxilo de cadena lateral, normalmente de aspartato o glutamato. Cicla un péptido o grapa una hélice sin usar un disulfuro, por lo que no es sensible a la reducción. PT-141 y Melanotan II se ciclan mediante un puente lactama Asp-Lys, que restringe el farmacóforo de melanocortina.
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