Fenilalanina (Phe, F)
La fenilalanina es un aminoácido hidrofóbico y aromático con una cadena lateral bencilo. Aporta empaquetamiento aromático y contactos de unión, y su isómero D es común en los péptidos sintéticos resistentes a proteasas.
Estructura y propiedades
La fenilalanina tiene un grupo bencilo, un anillo fenilo unido al esqueleto a través de un único metileno. El anillo es no polar y carece de grupos capaces de formar puentes de hidrógeno, lo que hace de la fenilalanina uno de los residuos estándar más hidrofóbicos. Se empaqueta en los núcleos de las proteínas y participa en apilamiento aromático e interacciones catión-pi con la arginina y la lisina. La fenilalanina absorbe débilmente la luz ultravioleta en comparación con el triptófano y la tirosina, por lo que contribuye poco a la cuantificación estándar de péptidos basada en UV. Es la precursora de la tirosina, que añade un grupo hidroxilo al anillo.
Función en los péptidos
La fenilalanina es un residuo frecuente de contacto con receptores. Se ubica en el núcleo de melanocortina His-Phe-Arg-Trp, y los análogos sintéticos como Melanotan II y PT-141 usan D-fenilalanina en esa posición. La ipamorelina y GHRP-6 también contienen D-fenilalanina, que resiste a las proteasas y altera la conformación. SS-31 termina en Phe-NH2, Kisspeptin-10 termina en un Arg-Phe-NH2 C-terminal y Semax contiene fenilalanina. Los pares aromáticos Phe-Phe también impulsan el autoensamblaje en algunos materiales peptídicos, y los análogos aromáticos halogenados o extendidos se usan para explorar los bolsillos de los receptores.
Estabilidad y análisis
La fenilalanina plantea pocos problemas específicos. El anillo es estable frente a la oxidación en condiciones normales de almacenamiento y no se cicla ni se desamida. La pureza quiral es el punto principal en los péptidos que dependen de la D-fenilalanina, ya que las formas L y D tienen la misma masa; los diastereómeros suelen separarse por HPLC cuando hay otros estereocentros. Los péptidos ricos en fenilalanina pueden ser poco solubles en agua y agregarse, por lo que las condiciones de disolución para el análisis pueden requerir algo de solvente orgánico.
En los compuestos de PeptideWiki
Compuestos cuya secuencia contiene fenilalanina, con el número de apariciones.
- IGF-1 LR3 (6)
- LL-37 (4)
- Exenatida (2)
- Kisspeptina-10 (2)
- Pramlintida (2)
- AOD-9604 (1)
- Afamelanotida (1)
- CJC-1295 (1)
- GHRP-2 (1)
- GHRP-6 (1)
- Humanina (1)
- Ipamorelin (1)
- MOTS-c (1)
- Melanotan II (1)
- PT-141 (bremelanotida) (1)
- SS-31 (elamipretida) (1)
- Semax (1)
- Sermorelina (1)
- Setmelanotida (1)
- Teriparatida (1)
- Tesamorelina (1)
- Timosina β4 (1)
- VIP (péptido intestinal vasoactivo) (1)
Preguntas frecuentes
¿Por qué algunos péptidos usan D-fenilalanina?
La mayoría de las proteasas reconocen L-aminoácidos, por lo que un residuo D en un sitio de corte o cerca de él ralentiza la degradación. La D-fenilalanina también cambia la geometría del esqueleto, lo que puede fijar un péptido en una forma que se une a un receptor mejor o de otra manera. Los análogos de melanocortina, varios secretagogos de hormona de crecimiento y muchos análogos de péptidos opioides usan D-fenilalanina por estas razones. Las formas D y L tienen la misma masa, por lo que se necesita un análisis quiral para confirmar cuál está presente.
¿La fenilalanina absorbe luz UV?
Sí, pero débilmente. Su absorbancia es mucho menor que la del triptófano o la tirosina y se encuentra a una longitud de onda más corta que la banda que se usa normalmente para cuantificar proteínas. En los péptidos sin triptófano ni tirosina, la cuantificación UV en esa banda no es fiable, por lo que la concentración suele basarse en la absorbancia del esqueleto a longitudes de onda bajas, el análisis de aminoácidos o el contenido de nitrógeno.
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