Ácido aspártico (Asp, D)
El ácido aspártico (aspartato) es un aminoácido ácido con una cadena lateral carboxilato corta. Aporta carga negativa en motivos de reconocimiento como RGD y es propenso a la isomerización y a la formación de aspartimida.
Estructura y propiedades
El ácido aspártico tiene una cadena lateral corta que termina en un ácido carboxílico desprotonado y, por lo tanto, con carga negativa a pH fisiológico. La cadena corta sitúa el carboxilato cerca del esqueleto, lo que le permite cerrar hélices y formar puentes de hidrógeno o puentes salinos con residuos básicos cercanos. El aspartato es fuertemente hidrofílico y casi siempre está expuesto al solvente. También se une a iones metálicos como el calcio, a menudo en cooperación con residuos ácidos vecinos. Su forma amida es la asparagina. La proximidad del carboxilo de la cadena lateral al esqueleto, que hace útil al aspartato desde el punto de vista estructural, es también el origen de su característica química de ciclación.
Función en los péptidos
El aspartato aporta carga negativa en muchos motivos de reconocimiento, el más conocido de los cuales es Arg-Gly-Asp (RGD) para la unión a integrinas. En los análogos cíclicos de melanocortina como PT-141 y Melanotan II, una cadena lateral de aspartato forma un puente lactama con la lisina para cerrar el anillo. Péptidos reguladores cortos como Epitalon (Ala-Glu-Asp-Gly) y Pinealon (Glu-Asp-Arg) son ácidos en gran parte debido al aspartato. BPC-157 contiene dos aspartatos adyacentes, y DSIP contiene aspartato en un tramo Asp-Ala-Ser. Reemplazar el aspartato por asparagina o glutamato es una prueba común de estructura-actividad para determinar si importa la carga o la longitud de la cadena lateral.
Estabilidad y análisis
El aspartato puede ciclarse a través de su esqueleto hasta una succinimida, que se reabre a isoaspartato; Asp-Gly es el motivo más susceptible. Los enlaces Asp-Pro son inusualmente lábiles en medio ácido y pueden escindirse en ácido fuerte. Durante la síntesis Fmoc, el tratamiento básico repetido puede impulsar la formación de aspartimida, produciendo isoaspartato y subproductos piperidida difíciles de separar. El isoaspartato tiene la misma masa que el aspartato, por lo que su detección depende de cambios en la retención en HPLC o de métodos de fragmentación especializados y no solo de la masa intacta.
En los compuestos de PeptideWiki
Compuestos cuya secuencia contiene ácido aspártico, con el número de apariciones.
- IGF-1 LR3 (4)
- Timosina α1 (3)
- Timosina β4 (3)
- Abaloparatida (2)
- BPC-157 (2)
- CJC-1295 (2)
- LL-37 (2)
- Sermorelina (2)
- Tesamorelina (2)
- VIP (péptido intestinal vasoactivo) (2)
- DSIP (1)
- Epitalon (1)
- Exenatida (1)
- Humanina (1)
- Melanotan II (1)
- PT-141 (bremelanotida) (1)
- Pinealon (1)
- Snap-8 (1)
- Teriparatida (1)
Preguntas frecuentes
¿Qué es la formación de aspartimida?
La formación de aspartimida es una reacción secundaria en la que el nitrógeno del esqueleto situado después de un aspartato ataca el éster o ácido de la cadena lateral, formando un anillo de cinco miembros. En la síntesis Fmoc en fase sólida la favorece la piperidina usada para la desprotección, especialmente en Asp-Gly, Asp-Asn y Asp-Ser. Luego el anillo se abre para dar productos con enlace alfa y beta y, a menudo, material racemizado. Los grupos protectores voluminosos en la cadena lateral y las condiciones de desprotección modificadas la reducen.
¿Puede la espectrometría de masas detectar el isoaspartato?
No a partir de la masa intacta, porque el aspartato y el isoaspartato son isómeros con masa idéntica. El isoaspartato suele cambiar ligeramente la retención en HPLC, y ciertas técnicas de fragmentación, como la disociación por transferencia de electrones o por captura de electrones, producen fragmentos diagnósticos. También se usan ensayos enzimáticos con la proteína isoaspartil metiltransferasa. Un certificado de análisis (COA) estándar basado en la masa intacta y un único cromatograma de HPLC puede no revelar niveles bajos de isoaspartato.
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