Prolina (Pro, P)
La prolina es un aminoácido cíclico cuya cadena lateral se une de nuevo al nitrógeno del esqueleto. Restringe rígidamente la conformación de los péptidos, rompe hélices, forma hélices de poliprolina y experimenta isomerización cis/trans.
Estructura y propiedades
La cadena lateral de la prolina forma un anillo de cinco miembros con su propio nitrógeno del esqueleto, lo que la convierte en una amina secundaria y fija uno de los ángulos del esqueleto. Esta rigidez reduce la flexibilidad, y la ausencia de un hidrógeno amida significa que la prolina no puede donar un puente de hidrógeno del esqueleto. Por lo tanto, la prolina altera las hélices alfa y las láminas beta excepto en sus extremos, y es común en los giros. Las series de prolinas adoptan la hélice de poliprolina II, una estructura extendida levógira importante en el reconocimiento de proteínas. Los enlaces que preceden a la prolina se isomerizan entre las formas cis y trans con mucha más facilidad que otros enlaces peptídicos, lo que ralentiza el plegamiento y genera heterogeneidad conformacional.
Función en los péptidos
La prolina es común en péptidos bioactivos cortos porque fija la forma y resiste a muchas proteasas. BPC-157 contiene una serie de tres prolinas. La cola Pro-Gly-Pro de Semax y Selank se añadió para ralentizar la degradación. KPV tiene prolina en su centro. La dipeptidil peptidasa-4 corta después de una prolina o alanina en la segunda posición, lo que condicionó el diseño de los análogos de GLP-1. Los péptidos antimicrobianos ricos en prolina actúan sobre dianas intracelulares en lugar de alterar principalmente las membranas.
Estabilidad y análisis
La isomerización cis/trans de los enlaces X-Pro puede producir picos de HPLC anchos o desdoblados y señales de RMN adicionales que corresponden a confórmeros, no a impurezas; aumentar la temperatura de la columna a menudo los fusiona. Los enlaces Asp-Pro son inusualmente lábiles en medio ácido. En la síntesis, la prolina en la segunda o tercera posición desde la resina favorece la formación de dicetopiperazina y la pérdida de cadena, y los acoplamientos sobre la amina secundaria de la prolina son más lentos. La prolina en sí no se oxida ni se racemiza con facilidad.
En los compuestos de PeptideWiki
Compuestos cuya secuencia contiene prolina, con el número de apariciones.
- IGF-1 LR3 (7)
- BPC-157 (4)
- Exenatida (4)
- Pramlintida (3)
- Selank (3)
- Timosina β4 (3)
- Calcitonina (de salmón) (2)
- Humanina (2)
- Semax (2)
- Afamelanotida (1)
- Gonadorelina (1)
- KPV (1)
- LL-37 (1)
- Larazotida (1)
- MOTS-c (1)
- Oxitocina (1)
- Triptorelina (1)
Preguntas frecuentes
¿Por qué la prolina produce picos de HPLC desdoblados?
El enlace anterior a una prolina puede estar en forma cis o trans, y la interconversión puede ser lenta en la escala de tiempo de una corrida de HPLC. Si las dos formas se separan parcialmente en la columna, el resultado es un pico ancho, con hombro o doble. Se trata de confórmeros de la misma molécula y no de impurezas. Trabajar con la columna a mayor temperatura acelera la interconversión y por lo general los fusiona, lo que es un diagnóstico útil.
¿Es la prolina técnicamente un aminoácido?
En sentido estricto, la prolina es un iminoácido según la terminología antigua, porque su nitrógeno es una amina secundaria unida al anillo de la cadena lateral. En el uso moderno se cuenta entre los veinte aminoácidos estándar y se incorpora a las proteínas de la manera habitual. El anillo es lo que confiere a la prolina sus efectos conformacionales característicos, incluida la ruptura de hélices y la isomerización cis/trans del enlace peptídico precedente.
Cite esta página